珠宝红外光谱仪是目前国内宝石鉴定实验室，普及、应用广的一款定性分析仪器。它可以在不损坏宝石样品的前提下，为检测人员提供重要鉴定参数。为鉴定和研究带来极大的帮助，摆脱单一的、对比式的鉴定模式，可以无损、便捷、高效对珠宝玉石进行定里、定性分析，大大缩短了鉴定时间，提高了鉴定结论的准确度。
珠宝红外光谱仪检测宝石样品，目前主要以实验数据为依据，因此还带有半经验性质。尽管如此，红外光谱还是极大地弥补了常规检测仪器的不足，并成为研究和检测宝玉石的一种新的无损鉴定手段。
珠宝红外光谱仪应用范围主要有两方面：
1.区分天然与合成宝石。尽管宝石内部所含的各种包裹体有助于宝石学家将天然宝石与合成宝石区分开。然而，对于一些内部几乎无瑕或所含的包裹体无所分辨的宝石，常规的宝石检测仪器就往往束手无策。相比之下，红外光谱能在很短的几分钟内提供快速、准确且无损伤的测试结果。
2.检测某些经人工优化处理的宝玉石。对于用塑料、环氧树脂和硅基聚合物等高分子材料浸染或充填的宝玉石材料，如欧泊、绿松石、翡翠、水晶等，用红外光谱检测亦有独到之处。
人们只需把测得未知物的红外光谱与标准库中的光谱进行比对，就可以迅速判定未知化合物的成份。
由于分子内和分子间相互作用，有机官能团的特征频率会由于官能团所处的化学环境不同而发生微细变化，这为研究表征分子内、分子间相互作用创造了条件。分子在低波数区的许多简正振动往往涉及分子中全部原子，不同的分子的振动方式彼此不同，这使得红外光谱具有像指纹一样高度的特征性，称为指纹区。
